在基于结构的药物设计中，一个重要步骤是预测蛋白的结合位点。PlayMolecule平台提供了一个在线工具DeepSite能够实现这一功能。
蛋白质子化工具ProteinPrepare
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cc
在进行分子模拟之前一般需要对蛋白的结构进行优化，包括确定质子化状态和优化氢键网络等。PlayMolecule平台的ProteinPrepare所提供的交互式和命令行工具（需下载离线版本）能够实现这一功能。
surflex对接基础
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cc
surflex 2.7 包括surflex-dock 和 surflex-sim. The former combines a refined descendant of the Hammerhead scoring function coupled with the alignment/conformation optimization proce-dures implemented for morphological similarity. The latter addresses aspects of computational drug design in the absence of a protein structure.
Matplotlib绘图基础
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python
Matplotlib是Python的一个工具包，提供了丰富的数据绘图工具，主要用于绘制一些统计图形。现将网络上多个学习Matplotlib的总结搬运至此，留作备忘。
Notepad++ 主题及字体设置
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工具
在Notepad++默认的字体中，数字1和字母l显示极为相近，因而有必要换用其它字体。现将网上更改Notepad++主题和字体的内容搬运至此。